Assistant-e (A2)

La Faculté de médecine de l'Université de Genève bénéficie d'une dynamique multiculturelle enrichissante à laquelle elle contribue par son rayonnement dans le cadre des mandats qu'elle s'est donnés : l'enseignement, la recherche et son partenariat avec les Hôpitaux Universitaires de Genève (HUG).

La Division de pathologie clinique, faisant partie intégrante du Département de diagnostique des Hôpitaux Universitaires de Genève (HUG) et du Département de pathologie et d'immunologie (PATIM) de la Faculté de médecine de l'Université de Genève (UNIGE), recherche :

intéressé-e par la recherche en pathologie numérique computationnelle.

Notre Division de pathologie clinique bénéficie d'un flux de travail clinique entièrement numérisé associé à une expertise informatique avancée et fournit ainsi un environnement unique pour le projet de recherche proposé.

Axe de recherche :

L'objectif principal du projet de recherche proposé est centré sur les maladies neuroinflammatoires affectant le système nerveux central (SNC), y compris le cerveau et la moelle épinière. Le projet utilise l'analyse d'images, l'apprentissage automatique et des techniques d'apprentissage spécifiques en vue de développer des algorithmes permettant d'identifier des caractéristiques spécifiques à la maladie et des marqueurs histopathologiques. L'analyse spatiale-omique et en combinaison avec des approches moléculaires complémentaires fera également partie du projet.

Plus particulièrement, et avec le soutien d'une cohorte unique de spécimens du SNC, le projet vise à:

• Développer des approches d'analyse computationnelle pour fournir des informations sur les mécanismes pathogéniques des processus immunitaires et de la pathogenèse des lésions.
• Identifier de nouveaux biomarqueurs à des fins diagnostiques, de prédiction du pronostic et de prédiction de la réponse au traitement.
• Compléter la recherche par des études mécanistes utilisant l'analyse d'images sur des modalités expérimentales.

L'élaboration de nouveaux biomarqueurs aidera à identifier les fondements mécaniques de la classification et de la progression de la maladie et à prédire les réponses au traitement. Le projet contribuera ainsi au domaine du diagnostic de précision et de la médecine de précision en général, permettant la création de plans de traitement optimisés et personnalisés.

• Grand intérêt pour le travail dans un environnement multidisciplinaire axé sur la médecine.
• Très bonnes capacités de communication (le projet est hautement translationnel et nécessite une communication accrue avec divers experts, notamment des pathologistes, techniciens, biologistes, bioinformaticiens et ingénieurs.
• Une expérience modérée de la programmation Python est requise (toute expérience dans l'analyse d'images et de la bioinformatique constituerait un atout).

01.10.2024

Les candidat-es intéressé-es sont prié-es de soumettre leur candidature à E-Mail schreiben, incluant un curriculum vitae et une lettre de motivation.

Le poste est basé au Centre Médical Universitaire, rue Michel-Servet 1, 1211 Genève 4.

Contrat de durée déterminée de droit privé d'un an (renouvelable).

The University of Geneva (UNIGE) offers a multicultural professional environment, research laboratories with cutting-edge technologies and a dynamic of sustained scientific exchange between the various departments involved.

The Faculty of Medicine at the University of Geneva thrives within this multicultural context, contributing significantly through its commitment to teaching, research, and its partnership with the University Hospitals of Geneva (HUG).

The Division of Clinical Pathology, part of the Department of Diagnostic at the University Hospital of Geneva (HUG) and the Department of Pathology and Immunology (PATIM) of the Faculty of Medicine of the University of Geneva (UNIGE), is looking for a :

interested in computational digital pathology research. Our Division of clinical pathology boasts a fully digitized pathology clinical workflow coupled with advanced computational expertise and thus provides a unique environment for the proposed research project.

Research focus :

The primary focus of the proposed research project is centered on neuroinflammatory diseases affecting the central nervous system (CNS), including the brain and spinal cord. The project utilizes image analysis, machine learning, and deep learning techniques to develop algorithms for identifying disease-specific features and histopathological markers. In addition, spatial-omics analysis and in combination with complementary molecular approaches will also be part of the project.

In particular, by leveraging a unique cohort of CNS specimens, the project aims to :

• Develop computational analysis approaches to provide insights into the pathomechanisms of immune processes and lesion pathogenesis.
• Identify novel biomarkers for diagnostic purposes, prognosis prediction, and therapy response prediction.
• Complement the research with mechanistic studies using image analysis on experimental modalities.

The elaboration of novel biomarkers will provide help to identify mechanistic underpinnings for disease classification & progression and predicting treatment responses. The project will thus contribute to the field of precision diagnostics and precision medicine in general, enabling the creation of optimized, personalized treatment plans.

Qualifications / requested profile :

• Strong interest in working within a multidisciplinary medically driven environment.
• Strong communication skills (the project is highly translational and requires communication with diverse experts, including pathologists, technicians, biologists, bioinformaticians, and engineers).
• Moderate Python programming experience is required (any experience with image analysis and bioinformatics is a plus).

Starting date :

October 1, 2024 or date to be agreed upon.

Application process :

Interested candidates should submit their application to E-Mail schreiben including a resume and cover letter, outlining their relevant experience and interest in the field.

L'Université de Genève offre des conditions d'engagement motivantes dans un cadre de travail stimulant. En nous rejoignant, vous aurez l'occasion de mettre en valeur vos compétences ainsi que votre personnalité et contribuer activement au rayonnement d'une Institution fondée en 1559.

Dans une perspective de parité, l'Université encourage les candidatures du sexe sous-représenté.